Questo nuovo tipo di armata comporta nuove sfide e ricompense. Per battere gli Xindi serve pianificazione e preparazione.

Di seguito trovate maggiori dettagli sul comportamento di queste nuove armate:

- All'inizio del turno, se l'arma finale xindi non ha Incendio in corso, il danno dell'arma aumenta di un X%. (Questa abilità si accumula illimitatamente)

- Ogni 8° turno, l'arma finale xindi spara con la sua super arma, infliggendo danno letale a una nave. È possibile disabilitare la super arma se l'arma finale xindi viene Assimilata prima dell'inizio del turno in cui dovrebbe sparare.

Queste armate si trovano nello spazio xindi, e possono avere 3 differenti picchi di difficoltà di livello 53, 56 e 60. Se sconfitte, lasceranno materiali, parti di nave e frammenti manufatto temporale.