"Per un Klingon non combattere è come non respirare! Fatti pure degli alleati, se devi, ma non lasciare mai l'Impero senza un nemico. I Klingon nascono per combattere e conquistare!"

La fazione dei Klingon è una delle tre fazioni principali in cui è possibile avanzare. Uccidendo forze ostili della Federazione, dei Romulani e dei Klingon, è possibile vedere i propri punti reputazione aumentare o diminuire. Per avanzare nei ranghi, bisogna ottenere reputazione positiva con le proprie azioni. Ci sono molti modi per raccogliere punti reputazione, ad esempio partecipando a eventi di fazione, distruggendo forze ostili delle fazioni rivali, completando missioni, ecc.

Al variare della propria reputazione, si viene "categorizzati" di conseguenza nel negozio di fazione dei Klingon. Se si rientra in una categoria inferiore a "Tollerato", appena si metterà piede nello spazio dei Klingon verrà generata una forza ostile di forza superiore al normale che proverà a distruggervi in risposta al tentativo di invasione!

Ogni grado di reputazione positiva sblocca nuovi oggetti, acquistabili dal negozio di fazione dei Klingon usando soprattutto i propri crediti dei Klingon. La lista di oggetti è lunga ma, tra gli altri, ci sono piani per navi dei Klingon, schede recluta dei Klingon e risorse grezze.

Nota importante: tra gli oggetti disponibili all'acquisto nel negozio di fazione, ci sono anche gli encomi; questi servono esclusivamente per specifiche missioni e vanno acquistati solamente quando una di queste missioni è attiva nella vostra lista.