Les factions offrent divers avantages, allant de vaisseaux exclusifs à une protection dans leur espace. Faire les bons choix est important, mais heureusement, rien ne vous oblige à n'en servir qu'une !

Avec les factions telles que la Fédération, les Romuliens et les Klingons, votre réputation peut se détériorer ou s'améliorer selon des actions spécifiques dans le jeu (choisir le mauvais camp lors d'une mission, abattre des vaisseaux de votre faction dans leur espace, etc.).

Dans les Factions ci-dessus, il y a quatre seuils de réputation à 10M de points, 1B de points, 15B de points et 500B de points.

Une fois un verrou atteint, votre réputation ne peut pas se détériorer au-delà de celui-ci. Cela vous procure un avantage unique lorsque vous voulez améliorer votre réputation auprès d'autres factions.

La réputation auprès des augmentés, des hors-la-loi et des Bajorans fonctionne autrement. Il n'y a pas de verrou pour ces factions, mais votre réputation auprès d'elles ne peut pas se détériorer.