La función Captura de Territorios introduce una nueva área del espacio llamada sector Origen. Esta área del espacio está dividida en zonas que pueden estar compuestas de uno o más sistemas. Compite con otras alianzas y gana más puntos que nadie durante la conquista de una zona para hacerte con esa zona y añadirla al territorio de tu alianza. Mientras tu alianza controle esa zona, todos sus miembros tendrán acceso a las ventajas que dicha zona ofrezca.

- No hay restricciones de nivel al realizar combates JcJ en el sector Origen.
Todos los sistemas del sector Origen se rigen por las normas de visibilidad del espacio profundo.

Conquistas
- En cada zona las conquistas deben realizarse en un periodo de tiempo determinado. Las alianzas deberán registrarse durante dicho periodo para participar en la conquista de dicha zona y conseguir puntos.
- La alianza que obtenga más puntos durante la conquista de una zona se hará con el control de dicha zona.

Ventajas del control de zonas
- Las alianzas que controlen una zona contarán con las siguientes ventajas:
Derechos exclusivos de reubicación: solo los miembros de una alianza que controle una zona podrán reubicar sus estaciones al sector Origen.
- Los jugadores que mantengan sus estaciones en zonas que no controle su alianza no podrán activar escudos de paz.

Derechos exclusivos de extracción
Solo los miembros de la alianza que controle una zona podrán realizar extracciones en los sistemas del sector Origen.
- Otros jugadores podrán seguir atacando a las naves mineras. La nave que consiga la victoria se hará con la carga que no esté protegida, pero no podrá atracar en la mina tras destruir la nave minera.

Servicios
- La alianza que controla un territorio consigue acceso exclusivo a la compra de ciertos servicios específicos disponibles en dicha zona. Los servicios ofrecen bonificaciones a todos los miembros de la alianza, y solo pueden activarlos aquellos miembros que sean comodoros o almirantes. Las zonas de categoría alta ofrecen servicios más valiosos que las zonas de categoría baja.
- Todos los servicios obtenidos al capturar zonas se acumulan, aunque se trate del mismo servicio y aunque provengan de la misma zona o de zonas distintas, y durarán hasta el final de la siguiente conquista.

Recursos de alianza
- Para participar en Captura de Territorios se precisan recursos específicos que pueden conseguir todos los miembros de la alianza y que se transfieren automáticamente al inventario de su alianza.
Los miembros de la alianza que cuenten con los permisos adecuados (los almirantes o los comodoros) pueden gastar recursos de alianza para participar en conquistas y activar servicios.
- Los recursos de alianza pertenecen a la alianza y seguirán en el inventario de alianza aunque el jugador que los consiguió decida abandonarla.