Der neue S31-Fraktions-Shop startet mit 6 Rängen und einer spannenden Sammlung von Belohnungen, darunter (aber nicht beschränkt auf) die neuen "Sektion-31-Gefälligkeiten", Buffs für die Wellenverteidigungs-Herausforderungen, einige besondere Überholungen, den "S31-Chiffre"-Wellenverteidigungs-Zutritts-Token, Prime-Partikel, Syndikats-EP, Sigma-Ressourcen und einen neuen permanenten Beschaffungsort für Offiziere der Einsatz-Crews + Carol Freeman.

Als Teil der S31-Vorteile und mit ausreichend gutem Ruf wird auch der "Armada-Schnellstart" über den Shop freischaltbar sein. Diese neue Funktion funktioniert nur für Allianz- und Einzel-Armadas und ermöglicht es dem Anführer, Beschleuniger zu verwenden, wann immer er oder sie will, nachdem die Armada gestartet wurde, um den Countdown-Timer zu verkürzen, anstatt zu warten. Je mehr du das Gebäude auflevelst, desto mehr Angebote werden im S31-Shop freigeschaltet.